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ツールDB

生命情報学ツール・データベース

　センターの構成メンバー及び協力メンバーは、生命情報学に関連する様々なツールやデータベースを構築しています。以下に挙げるリストはお茶の水女子大学から公開している生命情報学ツールとデータベースです。

  • kemba-svm.exe　雑音に頑健なPartial Distance Kernelを使用できるサポートベクトルマシン
  • KYG　RNA結合タンパク質の立体構造から結合面を予測
  • Takakia　Takakia lepidozioides葉緑体のRNAエディティング部位をcDNA配列のみから予測
  • RESOPS　RNAエディティング部位とタンパク質構造との関連ＤＢ
  • OCBI　Ochadai Computational Biology Initiative:構造バイオインフォマティクス関連のツールをみんなで少しずつ開発収集
  • SapD（開発中）　アカデミックプロダクションと協力して作成中の遺伝子解析ＤＢ